เทศบาลตำบลท่าขอนยางมีปัญหาเรื่องน้ำเสียไหลลงสู่แม่น้ำชี, และไหลลงสู่รางน้ำสาธารณะและพื้นที่ทางเกษตรของประชาชนในเขตพื้นที่ ซึ่งเกิดผลกระทบด้านสิ่งแวดล้อม การทำการเกษตรนาข้าว และส่งผลต่อสุขภาพของประชาชนจึงได้มีการดำเนินการแก้ไขปัญหาอย่างต่อเนื่อง